在我國，水產養殖尾水治理措施主要有物理、化學和生物法這三種。當下，較為常用且經濟的是歐保增強型三池兩壩工藝。

1）物理法

物理法主要借助機械曝氣、循環水過濾、污染物分離還有載體吸附等物理方式，削減水中粒徑較大的污染物，從而凈化養殖水。

物理法在養殖水處理里是最常運用的技術，歐保三池兩壩工藝中就用到了物理法，去除懸浮物。不過它存在只能去除大顆粒和懸浮物，無法除去溶解性污染物等弊端，對養殖廢水的凈化不夠徹底。

2）化學法

化學法包含化學氧化、化學沉淀、強化絮凝和底泥掩蔽等方法，這些方法能讓污染物從水體中分離出來，或者將其降解轉化成低毒或無毒的化學形態。但化學法使用成本偏高、長效管理困難，并且水體中殘留的絮凝劑、氧化劑等對魚類存在一定的毒性影響，容易給環境造成二次污染。

所以，在運用化學法處理養殖尾水時，減少水體中殘留的絮凝劑、氧化劑等含量是個亟待解決的問題。

3）生物法

生物法屬于一種生物技術方法，它通過多種生物間的相互作用，消除或者轉化某類污染物，提升生態環境的自我修復能力。生物法利用養殖水體中的內源微生物的自凈功能，降解養殖水中的氨氮等污染物，同時提高養殖水中的氧含量，使失衡的微生態系統得以恢復。

由于生物法運用的是水中的內源性微生物，所以不會產生次生污染物。微生物的投加方式主要包括直接投加、在活性污泥中定植以及在相應基質表面形成生物膜等。生物技術在緩流水體修復方面效果良好，運行成本比較低，不過在建設和維護時要采取措施避免受到底泥污染物濃度高影響植物生長、暴雨以及來水水質沖擊等問題。因此，歐保三池兩壩工藝中，采用再生濾壩作為生物載體，避免了微生物的流失。

總的來說，僅僅采用一種方法來處理尾水，其效率和效益都無法達到最高值。必須依據當地的實際情況，融合環境工程、生態工程相關的技術手段，充分考慮資源化、無害化和生態景觀效果等原則，構建因地制宜的生態綜合治理方案，進而解決水產養殖尾水的污染問題，達成污染零排放以及尾水凈化后的循環利用。而歐保增強型三池兩壩工藝，就綜合了這些措施治理水產養殖尾水。