徹底的截污工程是河流生態化整治的基礎，因此必須加大城市排水管網建設的投資力度，完善截污系統,提高城市污水集中收集和處理能力，為城市環境的改善奠定良好的基礎。

近年來，日本及韓國注重水利工程建設的生態平衡問題，重視人類活動與水環境的協調，大體經歷了從景觀設計到兼顧生態系統的多自然型河流整治模式，再到流域綜合治水模式等幾個階段。目前，我國治河工程的生態建設水平大致處于日本國上世紀年代后期重視景觀設計的階段。

要跨越治河工程生態建設的初級階段,一是要正確處理好河流治理和生態環境保護的關系,既要反對“自然環境論”者所主張一切要保持生態環境原始化的觀點,也要反對急功近利和掠奪型的水資源開發行為；二是要研究探索河流生態化整治工程建設的各種新途徑,克服以犧牲生態和環境為代價發展涉水工程的做法三是要將流域生態系統建設與管理作為流域水資源保護與管理的重要工作納入正常的軌道。

傳統治河工程對河流形態的多樣化重視不足，忽略了河流湖泊與陸地生態系統的有機聯系，忽視了江河堤防迎水坡面采用的硬質材料對植物生長和生物棲息的影響。為克服傳統治河工程在生態環境與生物多樣性保護方面的不足，應借鑒發達國家在興建治河水利工程中注重人類活動與環境的協調、重視河流生態系統平衡的做法。

首先針對具體河流的實際情況和特點，開展河流生態化整治工程建設的試點工作，積累經驗，逐步推廣其次，擬定河流生態化整治工程建設規劃，有步驟、有計劃地實施生態工程建設第三，擬定河流生態化整治工程的有關技術指引，包括河流形態多樣化、河岸覆蓋層、水生植物和陸生植物的保護等，以增強河流的環境和生態功能。第四，要注意引入公眾參與機制，讓沿河流域的居民充分行使參與權和建議權，在河流改造的初期就廣泛開展宣傳，讓更多的人了解、理解并支持河流的改造，讓河流的生態化整治工程真正成為利民工程、惠民工程。

傳統的治水工程強調的是人的力量,認為依靠工程措施開發和改造自然是人類力量的具體體現。盡管目前治水工程的科學技術水平得到高度的發展,治水事業取得很大的成就,但是距離科學地認識自然的演變規律和趨勢、重視保護和利用河流自凈能力、實現因勢利導、統籌兼顧、綜合治理的目標還有很大差距,很難實現“水利工程其本質都應該是生態工程”這一要求。

因此,堅持“人與自然和諧相處”,除了采用工程和非工程措施建設和恢復河流生態環境,還要充分發揮河流的自我修復能力,維護和恢復河流生態環境。

近年來，我國堤防工程建設取得很大成就,特別是完善工程的環境、生態、文化、景觀等功能方面均不同程度的取得良好的效果。不足之處在于，不少城市的堤防工程對環境、生態、文化以及景觀功能的考慮還不夠到位。

堤防工程建設要努力創造人與水相和諧的環境，通過改善空間環境，形成優美的景觀，提供完善的文化、體育、休閑娛樂、親水活動的場所保護水環境，確保足夠的水量和清潔水質,維持水域的自凈功能恢復良好的生態環境，形成良好的植物生長和動物棲息繁衍環境，為生態系統可持續發展和演替提供條件。