瑞士由于水環境保護和水質規定非常嚴格，所以保證了良性發展，有些地方的湖水可直接飲用。由于現代凈水技術的實施，人們可在瑞士任何湖泊河流中暢游，水質受到持續監控。瑞士自來水與礦泉水一樣純凈，卻便宜500倍。然而，這種狀況正在發生改變，由于各種污染的增加，尤其是來自農業和工業活動、都市化、運輸和空氣的污染增加，蓄水層水質在發生惡化。

瑞士是歐洲幾條主要河流的發源地，這使得防止污染在瑞士特別重要。自20 世紀50 年代起，瑞士重視水污染問題，開始制定法規，努力改善水的質量，建造污水和排流設備，對工業污水排放加以限制，逐漸開始修建家庭污水處理廠，各城市均有污水處理系統。瑞士擁有世界上功率最大的污水處理廠。瑞士可接受污水處理廠服務的人口從1965 年的12% 上升到2000 年的96% ，這30 多年中投入了400 多億瑞士法郎興建污水處理設施。經過多年治理，化學物質進入湖泊引起的環境問題部分得以解決，大多數河湖水質良好。

瑞士水管理的最大特點是具有較大的差異性，強烈的地方分權和在飲用水供應與衛生之間的不同管理模式，使水的分配和衛生方面的事務都屬于州的職權范圍內，通常讓市級委托管理。為了保護河流與湖泊水系水質，法律規定不能將未處理的工業和生活廢水直接排入附近任何水體，連近湖建筑物上的雨水也必須經屋檐排水槽引入地下，經過處理后才可排入水體。由于實施了嚴格的環境保護，瑞士全國幾十條河流、上千個湖泊常年清澈透明，且水質全部符合飲用水標準。