在苦溪河生態治理工程中, 通過各種增加河流形態多樣性的措施來改善河流生境多樣性，從而進一步改善河流生物群落的多樣性狀況。在河道縱向形態方面，遵循河流的自然地貌特征，盡力保持河流的自然蜿蜒形態，并避免傳統的直線化設計，通過一系列工程措施提高河流的空間異質性。在河道斷面的選擇上，采用多樣化的復合式河道斷面形式。在護岸設計方面, 盡量采用有利于植物生長的多孔、透水的護岸材料。在景觀美學方面，充分保留原有的湍流瀑布等自然景觀，并修繕保留現存古橋，構筑具有親水理念的景觀河道，為市民提供良好的親水休閑空間和優美的人居環境。

第一步，確定基本岸線方案，沿建堰壅水后的兩岸水邊線布置一級馬道，一級馬道靠河側邊緣即為岸線控制坐標；第二步，通過逐段分析，對篩選出的一些河段采取一定的工程措施，尋求防洪安全、生態修復與經濟建設用地的平衡點，以綜合效益最大化為判別標準，確定局部河段的最佳岸線方案；第三步，將基本案線方案與局部河段的最佳岸線方案組合，形成推薦岸線方案。

由以上步驟確定的推薦岸線方案具有以下特點：宜彎則彎，基本保留了河流的自然形態，避免了河流形態的直線化、規則化問題，使其蜿蜒性得以延續；河流兩岸岸坡距離寬窄相間，由整治前的10～30m變為40～300m；為濕地、河灣、急流和淺灘的保留和建造創造了條件。

考慮到苦溪河多年平均流量較小，縱坡較陡的特點，通過壅水堰的設置將窄深式河道變得寬闊，增加水景面積，并可形成急流與淺灘相間的河流地貌特征、跌水與瀑布相映的景觀，同時增加曝氣作用以加大水體中的含氧量。根據地形地質條件，在樁號3+115、3+925、4+180、5+740 處，布置了踏水橋、勝利橋、陡坎、汪家石塔四級壅水堰，踏水橋堰后坡為多級跌水，勝利橋堰后坡為1∶5緩坡，陡坎堰下接天然陡槽，汪家石塔堰后坡設觀景廊道。

根據河流地貌特征，沿河布置了總面積為27940m²的河濱濕地、河心濕地及湖濱濕地，在濕地內種植睡蓮、馬蹄蓮、香蒲等水生植物，從而可利用自然生態系統中物理、化學和生物的三重共同作用來實現對河流污水的凈化，并能緊密結合自然景觀建設。根據景觀生態學中綴塊—廊道—基底的空間景觀模式，為了增加河流景觀空間異質性，應有足夠數量大小相間的綴塊，把大綴塊與小綴塊合理搭配是提高空間異質性的重要途徑。

蜿蜒性是自然河流的重要特征。河流的蜿蜒性使得河流形成主流、支流、河灣、沼澤、急流和淺灘等豐富多樣的生境。由于流速不同，在急流和緩流的不同生境條件下，形成豐富多樣的生物群落，即急流生物群落和緩流生物群落。

在苦溪河整治段的縱斷面設計中，在滿足土地利用要求及河流岸坡沖刷安全的前提下，盡力保持了河流的自然蜿蜒性，并完全保留了建堰壅水后深潭與淺灘相間的自然狀態，既避免了河流形態的直線化，減小了水利工程對河流生態系統的脅迫，增加了自然美感，也節約了工程投資。

在苦溪河整治段的橫斷面設計中，采用多樣性較好的復合斷面型式，并根據過洪能力、岸坡穩定、現場條件等因素進行局部調整。在這種斷面形式中會出現深潭與淺灘交錯的布局。

淺灘的生境中，光熱條件優越，適于形成濕地，供鳥類、兩棲動物和昆蟲棲息。積水洼地中，魚類和各類軟體動物豐富，它們是肉食性候鳥的食物來源，鳥糞和魚類肥土又促進水生植物生長，水生植物又是植食鳥類的食物，形成了有利于珍禽生長的食物鏈。深潭的生境中，太陽光輻射作用隨水深加大而減弱。紅外線在水體表面幾厘米即被吸收，紫外線穿透能力也僅在幾米范圍。水溫隨深度變化，深水層水溫變化遲緩，與表層變化相比存在滯后現象。由于水溫、陽光輻射、食物和含氧量沿水深變化，在深潭中存在著生物群落的分層現象。

在馬道設計方面，根據河流親水性、路面滲透性、棲息地完整性等方面的需求在水邊設置了一級馬道或二級馬道。經實驗，滿足游人觸水要求的臨水邊與常水位之高差宜在0.1～0.25m的范圍內，所以將一級馬道沿各級壅水堰正常水位以上0.2m布置，為寬2m的休閑小道。為減少退水時河流飄浮物在馬道上的沉積，在垂直水流方向宜有一定坡度，同時考慮到人們行走的舒適度，沿垂直水流方向設5%的坡度。

在堤體填筑方面，盡可能不采用混凝土和漿砌石等剛性材料，如果局部地段因堤體穩定需要而必須采用剛性材料(或利用原建擋墻)時，將其高程控制在一級馬道以下。

在岸坡坡比選擇方面，應盡可能利用河流的自然岸坡，以保持岸坡的生境多樣性。在苦溪河整治段的設計中，人工邊坡采用緩坡設計，結合邊坡穩定、土地利用以及親水性等方面的要求來確定坡比，土質和平場棄渣堆積邊坡取為1∶3.5, 巖質邊坡視巖性及風化程度取為1∶1.5～1∶2.0，當自然坡比大于上述坡比時保持自然坡比。

岸坡防護設計中盡量采用有利于植物生長的多孔透水材料，特別注意采用當地天然材料，以保證水、土、氣之間的相互聯系，保持河流的橫向連通性，并減小發生生物入侵現象的可能性。綜合考慮抗沖性能與工程造價等因素，5年一遇洪水位與一級馬道間采用0.3m厚的石籠護岸，石籠內充填塊石，為利于植物生長，在石籠塊石中間扦插植物枝條，充填土壤,并在表層覆以耕作土同時撒播狗牙根草籽。

5年一遇洪水位與二級馬道間采用混凝土框格植草護岸，混凝土框格采用C25預制，斷面寬0.2m，高0.25m，框格間距2.5m，呈正方形45°布置，框格內進行植草，草種配置為麥冬、紫鴨草以及金心蘭；一級馬道以下保持自然狀態或素石支護；二級馬道以上為1∶3坡度的城市景觀帶，馬道靠河測植垂柳，間距為5m, 馬道外側植一排小灌木，灌木窩距0.25m。